重庆市交委以三峡工程蓄水为契机，致力于建设长江上游航运中心打造国际贸易水运大通道。

一是科学完善航运发展规划。组织专家形成《重庆统筹城乡交通发展战略研究》、《重庆构建长江上游地区综合交通枢纽战略研究》、《长江上游航运中心战略研究》等3个战略规划。使航运规划更具前瞻性和可持续性。

二是精心组织，提高航道等级。全力改造长江、嘉陵江、乌江航道，提高通行能力；形成主城、涪陵、万州3个枢纽港区；永川、江津、合川、奉节、武隆5个重点港区。到2012年力争建成主城寸滩、果园、南岸东港和茶园、九龙黄谦、万州江南、涪陵黄旗、长寿重钢新厂区、忠县海螺水泥厂等大型专业化码头。使重庆港成为长江干线南京以上最大的内河港口，继续保持货运船舶平均吨位居全国内河之首的地位。

三是优化运力结构。大力发展集装箱、化危品、干散货、滚装汽车和旅游客运等专业运输船舶。力争2012年全市港口货物吞吐能力达1.4吨，集装箱和滚装汽车吞吐能力分别达到300万标箱、160万辆，货运量达到1.2亿吨。形成以重庆保税港区为依托、航运企业聚集、航运要素市场活跃、配套服务完善的国际贸易与航运服务区。